本中心的管理，根據(jù)教育部《高等學(xué)校實驗室工作規(guī)程》和《濟南大學(xué)實驗室工作規(guī)程》相關(guān)規(guī)定進行。為加強實驗室運行管理工作，構(gòu)建實驗室運行保障體系，有效防范和遏制各類實驗室安全事故發(fā)生，保證實驗教學(xué)及科學(xué)研究工作安全進行。本中心實行校院兩級管理體制下的中心主任負責(zé)制，學(xué)校任命中心主任1人，在學(xué)校和學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)下，中心主任全面負責(zé)中心建設(shè)管理工作和實驗教學(xué)工作，負責(zé)制定中心整體發(fā)展規(guī)劃和階段性的建設(shè)目標(biāo)，負責(zé)組織申報實驗室建設(shè)項目。學(xué)校提供正常運轉(zhuǎn)、維修及更新改造經(jīng)費。

實驗教學(xué)中心設(shè)立學(xué)術(shù)委員會，由省內(nèi)外知名專家學(xué)者5人組成，負責(zé)指導(dǎo)中心的發(fā)展和建設(shè)。中心設(shè)立實驗教學(xué)指導(dǎo)委員會，由中心聘請教學(xué)、科研及工程經(jīng)驗豐富的教授、副教授及企業(yè)高級工程技術(shù)人員等擔(dān)任成員。實驗教學(xué)中心設(shè)主任1人、副主任5人，中心下設(shè)16個實驗教學(xué)組，開展經(jīng)常性的虛擬仿真實驗教學(xué)研討活動，交流教學(xué)經(jīng)驗，探討教學(xué)中的問題和不足，加強課程建設(shè)、教材建設(shè)和實踐基地建設(shè)。

本實驗中心除了為全校實驗教學(xué)、創(chuàng)新實驗、課程設(shè)計、畢業(yè)論文和畢業(yè)設(shè)計等正常的虛擬仿真實驗教學(xué)外，所屬的儀器設(shè)備、軟件還為大學(xué)生課外科技活動、國家與省化學(xué)實驗競賽、國家與省化工設(shè)計大賽、大學(xué)生挑戰(zhàn)杯、創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)活動等，面向校內(nèi)外全面開放。